====== cutadapt ======
cutadapt removes adapter sequences from high-throughput sequencing data. This is usually necessary when the read length of the sequencing machine is longer than the molecule that is sequenced, for example when sequencing microRNAs.
/* Description */

  * Site web : http://code.google.com/p/cutadapt/
  * Versions installées :
    * 1.6


===== Utilisation =====
==== Sélection de la version ====
Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[:modules]]

//cutadapt// a été placé dans l'ensemble ''bio''

Pour charger l'ensemble des logiciels de Bio, dans leurs versions par défaut : 
  module load bio

Pour charger seulement l'environnement de //cutadapt// en version 1.6 :
  module load bio/cutadapt 1.6

==== Travailler avec slurm ====
/* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */
/* Exemples de batch spécifiques */