====== fastqc ====== /* Description */ FastQC is an application which takes a FastQ file and runs a series of tests on it to generate a comprehensive QC report * Site web : http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html#fastqc * Versions installées : * 0.11.2 ===== Utilisation ===== ==== Sélection de la version ==== Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[:modules]] //FastQC// a été placé dans l'ensemble ''bio'' Pour charger l'ensemble des logiciels de Bio, dans leurs versions par défaut : module load bio Pour charger seulement l'environnement de //FastQC// en version 0.11.2 : module load bio/fastqc/0.11.2 ==== Travailler avec slurm ==== /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ /* Exemples de batch spécifiques */