====== COMSOL ======

Logiciel élément finis alliant généricité (mécaniques des fluides, électromagnétisme, mécaniques des structures, thermique) et puissance de calcul, permettant d'étudier un nombre illimité d'interactions entre différentes physiques (fluide caloporteur par exemple).

  * Version 3.5
  * Version 5.5 (licence XLIM - F. Gerome)

===== Utilisation =====
==== Sélection de la version ====
Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]]

Par exemple : 
  module load comsol/3.5

==== Soumission de batch - Version 3.5 ====
Pour soumettre des calculs COMSOL en mode batch, vous devez utilisez des fichiers (scripts) de commande COMSOL 

<note warning>Le script :
  * doit être placé dans un fichier se terminant par ".m", par exemple ''tpoisson.m''
  * ne doit pas contenir de signe ''-''
</note>

<file matlab tpoisson.m>
% Example demonstrating batch operation of a script driven 
% COMSOL Multiphysics model. Place this file
% in your working directory and give the command comsol batch myscript

% Solve the Poisson equation on the unit circle union with unit
% rectangle, using second order lagrange elements
     clear fem

     fem.geom = circ2+rect2;
     fem.mesh = meshinit(fem);
     fem.shape = 2; 
     fem.equ.c = 1;
     fem.equ.f = 1; 
     fem.bnd.h = 1;
     fem.xmesh = meshextend(fem);
     fem.sol = femlin(fem);

%Save the result in a binary file. Use flsave for COMSOL fem-structures
%and save for all other data. 
flsave pois fem


%A simple linear algebra operation
a=rand(4);
b=a'*a;

%Save the b matrix.
save bmatrex b;

</file>

Nous créons ensuite le fichier pour //slurm//, en exécutant COMSOL en parallèle (ici sur 16 processeurs, paramètre ''-np'' sur la ligne de commande). 

Notez que COMSOL fonctionne **en mémoire partagée et pas en mémoire distribuée**. Donc au maximum vous pourrez paralléliser sur 16 CPUs.

Fichier ''comsol.sbatch''  <file>
#!/bin/bash
#
#SLURM --partition=24h
#SLURM --qos=24h
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=16
#SBATCH --mem=512
#SBATCH --time 00:04:00

comsol batch -np $SLURM_CPUS_PER_TASK tpoisson
</file>

Nous soumettons le travail : <code>sbatch comsol.sbatch</code>

La sortie de Comsol sera dans le fichier d'output classique (ici ''slurm-//NNNNN//.out'')

Ensuite vous pourrez visualiser votre calcul via l'interface graphique de Comsol (fichier pois.mph dans l'exemple).