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fastqc

FastQC is an application which takes a FastQ file and runs a series of tests on it to generate a comprehensive QC report

Utilisation

Sélection de la version

Pour sélectionner la version voulue : utiliser les modules

FastQC a été placé dans l'ensemble bio

Pour charger l'ensemble des logiciels de Bio, dans leurs versions par défaut :

module load bio

Pour charger seulement l'environnement de FastQC en version 0.11.2 :

module load bio/fastqc/0.11.2

Travailler avec slurm