GS3

GS3 is a program that estimates fixed and random effects, breeding values and SNP effects for genomic selection. It includes normal, mixture, or double exponential distributions for SNP effects, i.e. GBLUP, the so-called BayesCPi, and the Bayesian Lasso. It allows estimation of the variances and effects of SNPs, polygenic and environmental effects, and also the inclusion of heterogeneous variances as for the analysis of DYD's.

• Site web : http://snp.toulouse.inra.fr/~alegarra/
• Versions installées :
  • Version en date août 2011

Pour sélectionner la version voulue : utiliser les modules

GS3 a été placé dans l'ensemble bio

Pour charger l'ensemble des logiciels de Bio, dans leurs versions par défaut :

module load bio

Pour charger seulement l'environnement de LOGICIEL dans une version particulière :

module load bio/GS3/2011-08