Assisted Model Building with Energy Refinement : “Amber” refers to two things: a set of molecular mechanical force fields for the simulation of biomolecules (AmberTools, public domain) ; and a package of molecular simulation programs.

• Site web : http://ambermd.org/
• Versions installées :
  • AmberTools (libre) : v14
  • Amber (payant) : v12 avec AmberTools v13

installation en cours

Pour sélectionner la version voulue : utiliser les modules

Pour utiliser Amber 12 avec AmberTools 13 :

module load amber/12

Pour utilsier Amber 12 avec AmberTools 14 :

module load amber/12-tools14