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logiciels:bio:bwa
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| ===== Citation ===== | ===== Citation ===== | ||
| - | How can I cite BWA? | + | Les auteurs demandent la citation de leur article si vous utilisez des résultats de BWA dans vos propres publications : |
| - | The short read alignment | + | If you use the BWA-backtrack algorithm : |
| + | Li H. and Durbin R. (2009) Fast and accurate | ||
| + | Burrows-Wheeler transform. *Bioinformatics*, | ||
| + | [19451168][10]]. | ||
| - | Li H. and Durbin R. (2009) Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler Transform. Bioinformatics, | + | If you use the BWA-SW |
| - | + | Li H. and Durbin R. (2010) Fast and accurate long-read alignment with | |
| - | If you use BWA-SW, please cite: | + | |
| - | Li H. and Durbin R. (2010) Fast and accurate long-read alignment with Burrows-Wheeler | + | [20080505][11]]. |
| - | + | ||
| - | (See also Errata below for a minor correction to the formulae in these papers.) | + | |
| + | If you use the BWA-MEM algorithm or the **fastmap** command, or want to cite the whole BWA package : | ||
| + | Li H. (2013) Aligning sequence reads, clone sequences and assembly contigs | ||
| + | with BWA-MEM. [arXiv: | ||
| ===== Utilisation ===== | ===== Utilisation ===== | ||
| ==== Sélection de la version ==== | ==== Sélection de la version ==== | ||
| - | Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]] | + | Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[: |
| Par exemple : | Par exemple : | ||
logiciels/bio/bwa.1412960183.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/10 18:56 de montap01
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