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logiciels:bio:bwa

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BWA

BWA is a software package for mapping DNA sequences against a large reference genome, such as the human genome.

Citation

How can I cite BWA?

The short read alignment component (bwa-short) has been published:

Li H. and Durbin R. (2009) Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler Transform. Bioinformatics, 25:1754-60. [PMID: 19451168]

If you use BWA-SW, please cite:

Li H. and Durbin R. (2010) Fast and accurate long-read alignment with Burrows-Wheeler Transform. Bioinformatics, Epub. [PMID: 20080505]

(See also Errata below for a minor correction to the formulae in these papers.)

Utilisation

Sélection de la version

Pour sélectionner la version voulue : utiliser les modules

Par exemple :

module load bio/bwa/0.7.10

Ou pour charger tous l'environnement de Biologie avec les versions par défaut :

module load bio
logiciels/bio/bwa.1412960192.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/10 18:56 de montap01