cutadapt removes adapter sequences from high-throughput sequencing data. This is usually necessary when the read length of the sequencing machine is longer than the molecule that is sequenced, for example when sequencing microRNAs.

• Site web : http://code.google.com/p/cutadapt/
• Versions installées :
  • 1.6

Pour sélectionner la version voulue : utiliser les modules

cutadapt a été placé dans l'ensemble bio

Pour charger l'ensemble des logiciels de Bio, dans leurs versions par défaut :

module load bio

Pour charger seulement l'environnement de cutadapt en version 1.6 :

module load bio/cutadapt 1.6