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The Genome Analysis Toolkit or GATK is a software package developed at the Broad Institute to analyze high-throughput sequencing data. The toolkit offers a wide variety of tools, with a primary focus on variant discovery and genotyping as well as strong emphasis on data quality assurance. Its robust architecture, powerful processing engine and high-performance computing features make it capable of taking on projects of any size.
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gatk a été placé dans l'ensemble bio
Pour charger l'ensemble des logiciels de Bio, dans leurs versions par défaut :
module load bio
Pour charger seulement l'environnement de bedtools en version 3.2-2 :
module load bio/gatk/3.2-2