Calcul en Limousin

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====== MIRA ======
/* Description */
MIRA is a whole genome shotgun and EST sequence assembler for Sanger, 454, Solexa (Illumina), IonTorrent data and PacBio (the later at the moment only CCS and error-corrected CLR reads). It can be seen as a Swiss army knife of sequence assembly developed and used in the past 16 years to get assembly jobs done efficiently - and especially accurately. That is, without actually putting too much manual work into finishing the assembly.


  * Site web : http://sourceforge.net/p/mira-assembler/wiki/Home/
  * Versions installées :
    * 4.0.2_gnu_x86_64_static (version livrée pré-compilé, compilateurs GNU, en statique)
    * 4.9.3_gnu_x86_64_static (version de développement, livrée pré-compilé, compilateurs GNU, en statique)


===== Utilisation =====
==== Sélection de la version ====
Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[:modules]]

//MIRA// a été placé dans l'ensemble ''bio'', mais n'est pas chargé par défaut.

Pour charger seulement l'environnement de //MIRA// dans une version particulière :
  module load bio/mira/4.0.2_gnu_x86_64_static

==== Travailler avec slurm ====
/* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */
/* Exemples de batch spécifiques */

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