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logiciels:bio:tophat

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-TopHat is a fast splice junction mapper for RNA-Seq reads. It aligns RNA-Seq reads to mammalian-sized genomes using the ultra high-throughput short read aligner [[Bowtie]], and then analyzes the mapping results to identify splice junctions between exons.+TopHat is a fast splice junction mapper for RNA-Seq reads. It aligns RNA-Seq reads to mammalian-sized genomes using the ultra high-throughput short read aligner [[logiciels:bio:Bowtie]], and then analyzes the mapping results to identify splice junctions between exons.
  
   * Site web : http://ccb.jhu.edu/software/tophat/index.shtml   * Site web : http://ccb.jhu.edu/software/tophat/index.shtml
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 ===== Utilisation ===== ===== Utilisation =====
 ==== Sélection de la version ==== ==== Sélection de la version ====
-Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]]+Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[:modules]]
  
 //TopHat// a été placé dans l'ensemble ''bio'' //TopHat// a été placé dans l'ensemble ''bio''
logiciels/bio/tophat.1413790567.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/20 09:36 de montap01