Outils pour utilisateurs
logiciels:bio:vcftools
Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
|
logiciels:bio:vcftools [2014/10/21 17:00] montap01 [Utilisation] |
logiciels:bio:vcftools [2014/10/22 11:37] (Version actuelle) montap01 Page moved from logiciels:vcftools to logiciels:bio:vcftools |
||
|---|---|---|---|
| Ligne 6: | Ligne 6: | ||
| * Site web : http:// | * Site web : http:// | ||
| * Versions installées : | * Versions installées : | ||
| - | * | + | * 0.1.12b |
| - | + | * 0.1.12b | |
| - | FIXME Installation | + | |
| ===== Citation ===== | ===== Citation ===== | ||
| Ligne 15: | Ligne 14: | ||
| < | < | ||
| Citation: | Citation: | ||
| - | | + | If you make use of VCFtools in your research, we would appreciate a |
| - | citation of the following paper: | + | |
| - | | + | The Variant Call Format and VCFtools, |
| - | Petr Danecek, Adam Auton, Goncalo Abecasis, Cornelis A. Albers, | + | Petr Danecek, Adam Auton, Goncalo Abecasis, Cornelis A. Albers, |
| - | Eric Banks, Mark A. DePristo, Robert Handsaker, Gerton Lunter, | + | Eric Banks, Mark A. DePristo, Robert Handsaker, Gerton Lunter, |
| - | Gabor Marth, Stephen T. Sherry, Gilean McVean, Richard Durbin | + | Gabor Marth, Stephen T. Sherry, Gilean McVean, Richard Durbin |
| - | and 1000 Genomes Project Analysis Group, Bioinformatics, | + | and 1000 Genomes Project Analysis Group, Bioinformatics, |
| | | ||
| - | | + | http:// |
| </ | </ | ||
| ===== Utilisation ===== | ===== Utilisation ===== | ||
| ==== Sélection de la version ==== | ==== Sélection de la version ==== | ||
| - | Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]] | + | Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[: |
| + | |||
| + | // | ||
| - | Par exemple | + | Pour charger l' |
| - | module load vcftools | + | module load bio |
| + | Pour charger seulement l' | ||
| + | module load bio/ | ||
| ==== Travailler avec slurm ==== | ==== Travailler avec slurm ==== | ||
| /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ | /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ | ||
| /* Exemples de batch spécifiques */ | /* Exemples de batch spécifiques */ | ||
logiciels/bio/vcftools.1413903645.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/21 17:00 de montap01
Outils de la page
Sauf mention contraire, le contenu de ce wiki est placé sous les termes de la licence suivante : CC Attribution-Share Alike 4.0 International
