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logiciels:gamess

GAMESS

The General Atomic and Molecular Electronic Structure System (GAMESS) is a general ab initio quantum chemistry package.

Citation

GAMESS n'est pas un logiciel libre. Sa licence impose entre autre la contrainte suivante :

If results obtained with GAMESS are published in the scientific literature, I will reference the program from the article M.W.Schmidt, K.K.Baldridge, J.A.Boatz, S.T.Elbert, M.S.Gordon, J.H.Jensen, S.Koseki, N.Matsunaga, K.A.Nguyen, S.J.Su, T.L.Windus, M.Dupuis, J.A.Montgomery J. Comput. Chem. 14, 1347-1363 (1993). Using specific methods included in GAMESS may require citing additional articles, as described in the manual. I agree to honor the request to cite additional papers, as appropriate.

Vous devez donc respecter ces conditions si vous utilisez des résultats obtenus avec GAMESS

Paramètres de compilation

Plusieurs paramètres peuvent être réglés uniquement lors de la phase de compilation de GAMESS.

Paramètres de parallélisation

set MAXCPUS  = 16
set MAXNODES = 256

Paramètres de taille max des systèmes

Les paramètres de taille max modificables sont :

MXATM = max number of ab initio atoms
MXAO  = max number of basis functions
MXGSH = max number of Gaussians per shell
MXSH  = max number of symmetry unique shells
MXGTOT= max number of symmetry unique Gaussians
MXRT  = max number of MCSCF/CI states
MXFRG = max number of effective fragment potentials
MXDFG = max number of different effective fragments
MXPT  = max number of points in any one term of any EFP
MXFGPT= maximum storage for all EFPs, and is sized for a large number of EFPs 
        with a small number of points (solvent applications), or a smaller
        number of EFPs with many points (biochemistry).
MXSP  = max number of spheres (sfera) in PCM
MXTS  = max number of tesserae in PCM
MXABC = max number of A,B,C matrices in the COSMO algorithm. The default value 
        of 6000 allows the construction of cavities for roughly 150 to 200 atoms.

La version 00 de Gamess a été compilée avec les paramètres suivants (valeurs par défaut) :

MXATM=2000
MXAO=8192
MXGSH=30
MXSH=5000
MXGTOT=20000
MXRT=100
MXFRG=1050
MXDFG=5
MXPT=2000
MXFGPT=12000
MXSP=0
MXABC=6000

Si vous avez besoin de systèmes plus grands, donnez-nous les valeurs adaptées.

Utilisation

Sélection de la version

Pour sélectionner la version voulue : utiliser les modules

Par exemple :

module load gamess

Commande GAMESS

Une fois l'environnement chargé, le binaire s'appelle gamess.<build>.x

Travailler avec slurm

logiciels/gamess.txt · Dernière modification: 2014/10/10 19:20 de montap01