Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- logiciels:mkl:mkl-et-parallelisme [2015/06/04 10:53]
montap01
+++ logiciels:mkl:mkl-et-parallelisme [2015/06/04 11:49] (Version actuelle)
montap01 [Réserver un nœud complet]
@@ Ligne 85: / Ligne 85: @@
 Puisque la MKL "mange" par défaut tous les cœurs d'une machine, la stratégie consistera ici à s'assurer que votre job disposera d'un nœud dans son intégralité. Ici encore, plusieurs solutions sont possibles, nous nous limiterons à vous proposer la plus "souple".
-FIXME vérifier comment et si on peut réserver un noeud complet
+Ajouter dans votre fichier de job :
+<file>
+#SBATCH --exclusive
+</file>
 ==== Réserver le "bon" nombre de cœurs ====
-FIXME
+Cette stratégie consiste simplement à réserver N cœurs au niveau de slurm (en vous rappelant que slurm les appelle des CPU), et à indiquer ce nombre à la MKL. Nous construisons simplement ci-après un job de type OpenMP :
+<file>
+#!/bin/bash
+#
+#SBATCH --ntasks=1
+#SBATCH --cpus-per-task=8
+#SBATCH --mem-per-cpu=300
+#SBATCH --time 00:01:00
+export OMP_NUM_THREADS=$SLURM_CPUS_PER_TASK
+./mon_programme
+</file>
 ==== Passer en séquentiel ====
 Bien entendu, si vous rencontrez des problèmes de sur-allocation ou en cas de doute, vous pouvez aussi passer en mode séquentiel :

Calcul en Limousin