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logiciels:nwchem
Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Prochaine révision | Révision précédente | ||
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logiciels:nwchem [2014/10/17 14:02] montap01 créée |
logiciels:nwchem [2014/12/02 20:30] (Version actuelle) montap01 [Commandes] |
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|---|---|---|---|
| Ligne 6: | Ligne 6: | ||
| * Site web : http:// | * Site web : http:// | ||
| * Versions installées : | * Versions installées : | ||
| - | * 6.5 | + | * 6.5, compilé sans support de SCALAPACK, sans MKL (BLAS interne) et mode MPI " |
| - | FIXME installation en cours | ||
| + | <hidden Cliquez ici pour connaître les détails de compilation> | ||
| + | Variables définies pour préparer la compilation : | ||
| + | |||
| + | < | ||
| + | export NWCHEM_TOP=$(pwd) | ||
| + | export NWCHEM_TARGET=LINUX64 | ||
| + | export ARMCI_NETWORK=MPI-MT | ||
| + | |||
| + | export USE_MPI=y | ||
| + | export USE_MPIF=y | ||
| + | # Pas de USE_MPIF4=y, | ||
| + | export LIBMPI=" | ||
| + | -L${I_MPI_ROOT}/ | ||
| + | -Xlinker --enable-new-dtags \ | ||
| + | -Xlinker -rpath -Xlinker ${I_MPI_ROOT}/ | ||
| + | -Xlinker -rpath -Xlinker ${I_MPI_ROOT}/ | ||
| + | -Xlinker -rpath -Xlinker / | ||
| + | -Xlinker -rpath -Xlinker / | ||
| + | -lmpi_ilp64 -lmpifort -lmpi_mt -lmpigi -ldl -lrt -lpthread" | ||
| + | export MPI_LIB=${I_MPI_ROOT}/ | ||
| + | export MPI_INCLUDE=${I_MPI_ROOT}/ | ||
| + | |||
| + | export NWCHEM_MODULES=" | ||
| + | |||
| + | export PYTHONHOME=/ | ||
| + | export PYTHONVERSION=2.6 | ||
| + | export USE_PYTHON64=y | ||
| + | export PYTHONLIBTYPE=so | ||
| + | |||
| + | # Pas de BLASOPT | ||
| + | # Pas de USE_SCALAPACK | ||
| + | |||
| + | export NWCHEM_MPIF_WRAP=" | ||
| + | export NWCHEM_MPIC_WRAP=" | ||
| + | export NWCHEM_MPICXX_WRAP=" | ||
| + | </ | ||
| + | </ | ||
| ===== Citation ===== | ===== Citation ===== | ||
| - | <file> | + | <QUOTE> |
| Please cite the following reference when publishing results obtained with NWChem: | Please cite the following reference when publishing results obtained with NWChem: | ||
| + | |||
| M. Valiev, E.J. Bylaska, N. Govind, K. Kowalski, T.P. Straatsma, H.J.J. van Dam, D. Wang, J. Nieplocha, E. Apra, T.L. Windus, W.A. de Jong, " | M. Valiev, E.J. Bylaska, N. Govind, K. Kowalski, T.P. Straatsma, H.J.J. van Dam, D. Wang, J. Nieplocha, E. Apra, T.L. Windus, W.A. de Jong, " | ||
| - | </file> | + | </QUOTE> |
| ===== Utilisation ===== | ===== Utilisation ===== | ||
| Ligne 22: | Ligne 59: | ||
| Par exemple : | Par exemple : | ||
| - | module load matlab/R2014a | + | module load nwchem |
| + | |||
| + | :!: Ce logiciel est compilé dynamiquement avec la librairie MKL, le module '' | ||
| ==== Travailler avec slurm ==== | ==== Travailler avec slurm ==== | ||
| /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ | /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ | ||
| /* Exemples de batch spécifiques */ | /* Exemples de batch spécifiques */ | ||
logiciels/nwchem.1413547369.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/17 14:02 de montap01
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