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logiciels:nwchem

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Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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logiciels:nwchem [2014/10/17 14:05]
montap01 [Citation]
logiciels:nwchem [2014/12/02 20:30] (Version actuelle)
montap01 [Commandes]
Ligne 6: Ligne 6:
   * Site web : http://www.nwchem-sw.org/index.php/Main_Page   * Site web : http://www.nwchem-sw.org/index.php/Main_Page
   * Versions installées :   * Versions installées :
-    * 6.5+    * 6.5, compilé sans support de SCALAPACK, sans MKL (BLAS interne) et mode MPI "MPI-MT"
  
-FIXME installation en cours 
  
 +<hidden Cliquez ici pour connaître les détails de compilation>
 +Variables définies pour préparer la compilation : 
 +
 +<code>
 +export NWCHEM_TOP=$(pwd)
 +export NWCHEM_TARGET=LINUX64
 +export ARMCI_NETWORK=MPI-MT
 +
 +export USE_MPI=y
 +export USE_MPIF=y
 +# Pas de USE_MPIF4=y, on utilise la lib MPI compatible integer*8 (-ilp64)
 +export LIBMPI="\
 +  -L${I_MPI_ROOT}/intel64/lib/release -L${I_MPI_ROOT}/intel64/lib \
 +  -Xlinker --enable-new-dtags \
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker ${I_MPI_ROOT}/intel64/lib/release \
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker ${I_MPI_ROOT}/intel64/lib \
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker /opt/intel/mpi-rt/5.0/intel64/lib/release \
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker /opt/intel/mpi-rt/5.0/intel64/lib \
 +  -lmpi_ilp64 -lmpifort -lmpi_mt -lmpigi -ldl -lrt -lpthread"
 +export MPI_LIB=${I_MPI_ROOT}/intel64/lib
 +export MPI_INCLUDE=${I_MPI_ROOT}/intel64/include
 +
 +export NWCHEM_MODULES="all python"
 +
 +export PYTHONHOME=/usr
 +export PYTHONVERSION=2.6
 +export USE_PYTHON64=y
 +export PYTHONLIBTYPE=so
 +
 +# Pas de BLASOPT
 +# Pas de USE_SCALAPACK
 +
 +export NWCHEM_MPIF_WRAP="${I_MPI_ROOT}/bin64/mpiifort -mt_mpi -ilp64"
 +export NWCHEM_MPIC_WRAP="${I_MPI_ROOT}/bin64/mpiicc   -mt_mpi -ilp64"
 +export NWCHEM_MPICXX_WRAP="${I_MPI_ROOT}/bin64/mpiicpc  -mt_mpi -ilp64"
 +</code>
 +</hidden>
 ===== Citation ===== ===== Citation =====
  
Ligne 23: Ligne 59:
  
 Par exemple :  Par exemple : 
-  module load matlab/R2014a+  module load nwchem 
 + 
 +:!: Ce logiciel est compilé dynamiquement avec la librairie MKL, le module ''intel/composer/xe_2015.0.090'' doit être également chargé (chargé par défaut sur CALI). 
  
 ==== Travailler avec slurm ==== ==== Travailler avec slurm ====
 /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */
 /* Exemples de batch spécifiques */ /* Exemples de batch spécifiques */
logiciels/nwchem.1413547541.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/17 14:05 de montap01