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logiciels:nwchem

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Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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logiciels:nwchem [2014/10/20 19:40]
montap01 [NWChem] 		logiciels:nwchem [2014/12/02 20:30] (Version actuelle)
montap01 [Commandes]
Ligne 6: Ligne 6:
   * Site web : http://www.nwchem-sw.org/index.php/Main_Page   * Site web : http://www.nwchem-sw.org/index.php/Main_Page
   * Versions installées :   * Versions installées :
-    * 6.5, compilé avec support de SCALAPACK, paramètre ''ARMCI_NETWORK=OPENIB'', en deux versions librairie MKL threadé et non threadé+    * 6.5, compilé sans support de SCALAPACK, sans MKL (BLAS interne) et mode MPI "MPI-MT" 
 + 
 + 
 +<hidden Cliquez ici pour connaître les détails de compilation> 
 +Variables définies pour préparer la compilation :  
 + 
 +<code> 
 +export NWCHEM_TOP=$(pwd) 
 +export NWCHEM_TARGET=LINUX64 
 +export ARMCI_NETWORK=MPI-MT 
 + 
 +export USE_MPI=y 
 +export USE_MPIF=y 
 +# Pas de USE_MPIF4=y, on utilise la lib MPI compatible integer*8 (-ilp64) 
 +export LIBMPI="\ 
 +  -L${I_MPI_ROOT}/intel64/lib/release -L${I_MPI_ROOT}/intel64/lib \ 
 +  -Xlinker --enable-new-dtags \ 
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker ${I_MPI_ROOT}/intel64/lib/release \ 
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker ${I_MPI_ROOT}/intel64/lib \ 
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker /opt/intel/mpi-rt/5.0/intel64/lib/release \ 
 +  -Xlinker -rpath -Xlinker /opt/intel/mpi-rt/5.0/intel64/lib \ 
 +  -lmpi_ilp64 -lmpifort -lmpi_mt -lmpigi -ldl -lrt -lpthread" 
 +export MPI_LIB=${I_MPI_ROOT}/intel64/lib 
 +export MPI_INCLUDE=${I_MPI_ROOT}/intel64/include 
 + 
 +export NWCHEM_MODULES="all python" 
 + 
 +export PYTHONHOME=/usr 
 +export PYTHONVERSION=2.6 
 +export USE_PYTHON64=y 
 +export PYTHONLIBTYPE=so 
 + 
 +# Pas de BLASOPT 
 +# Pas de USE_SCALAPACK 
 + 
 +export NWCHEM_MPIF_WRAP="${I_MPI_ROOT}/bin64/mpiifort -mt_mpi -ilp64" 
 +export NWCHEM_MPIC_WRAP="${I_MPI_ROOT}/bin64/mpiicc   -mt_mpi -ilp64" 
 +export NWCHEM_MPICXX_WRAP="${I_MPI_ROOT}/bin64/mpiicpc  -mt_mpi -ilp64" 
 +</code> 
 +</hidden>
 ===== Citation ===== ===== Citation =====
  
Ligne 24: Ligne 63:
 :!: Ce logiciel est compilé dynamiquement avec la librairie MKL, le module ''intel/composer/xe_2015.0.090'' doit être également chargé (chargé par défaut sur CALI). :!: Ce logiciel est compilé dynamiquement avec la librairie MKL, le module ''intel/composer/xe_2015.0.090'' doit être également chargé (chargé par défaut sur CALI).
  
-==== Commandes ==== +
-  * ''nwchem'' pour la version MKL séquentiel et SCALAPCK +
-  * ''nwchem-mkl-openmp'' pour la version MKL threadé et SCALAPACK+
 ==== Travailler avec slurm ==== ==== Travailler avec slurm ====
 /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */
 /* Exemples de batch spécifiques */ /* Exemples de batch spécifiques */
logiciels/nwchem.1413826852.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/20 19:40 de montap01

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