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logiciels:orca

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logiciels:orca [2014/10/17 13:51]
montap01 créée
logiciels:orca [2014/10/28 20:12] (Version actuelle)
montap01 [Exemple d'utilisation en mode parallèle]
Ligne 13: Ligne 13:
 Extrait de la licence d'utilisation : Extrait de la licence d'utilisation :
 <file> <file>
-4.If results obtained with ORCA package are published in scientific literature, you will reference the program as F. Neese: The ORCA program system (WIREs Comput Mol Sci 2012, 2: 73-78). Using specific methods included in ORCA may require citing additional articles, as described in the manual. You agree to honor the request to cite additional papers as appropriate.+4.If results obtained with ORCA package are published in scientific literature,  
 +you will reference the program as F. Neese: The ORCA program system (WIREs Comput Mol Sci 2012, 2: 73-78).  
 +Using specific methods included in ORCA may require citing additional articles, as described in the manual. 
 +You agree to honor the request to cite additional papers as appropriate.
 </file> </file>
 ===== Utilisation ===== ===== Utilisation =====
Ligne 20: Ligne 23:
  
 <note warning> <note warning>
-Les versions MPI d'Orca sont liées à la librairie OpenMPI, qui n'est pas la librairie MPI usuelle sur notre cluster. Il faut donc charger aussi le module MPI convenable pour faire fonctionner Orca en mode MPI.+Les versions MPI d'Orca sont liées à la librairie OpenMPI, qui n'est pas la librairie MPI usuelle sur notre cluster. Lorsque vous chargerez le module d'Orca, celui-ci va également charger le module MPI convenable, ce qui va donc changer aussi votre environnement pour MPI
 </note> </note>
 Par exemple :  Par exemple : 
-  module unload mpi 
-  module load mpi/openmpi 
   module load orca   module load orca
  
Ligne 48: Ligne 49:
  
 ==== Exemple d'utilisation en mode parallèle ==== ==== Exemple d'utilisation en mode parallèle ====
-Cobsultez la documentatiopn d'Orca+Consultez la documentation d'Orca.
  
-Votre fichier de commande Orca doit contenir l'une des syntaxes suivantes : +Votre fichier de commande Orca doit contenir l'une des syntaxes suivantes. Ici, on demande une parallélisation sur 4 processeurs :
  
 <file> <file>
Ligne 70: Ligne 71:
 #SBATCH --time=04:00:00 #SBATCH --time=04:00:00
  
-module unload mpi 
-module load mpi/openmpi 
 module load orca module load orca
  
 srun $ORCA_BIN/orca fichier_entree.inp srun $ORCA_BIN/orca fichier_entree.inp
 </file> </file>
 +
 +~~DISCUSSION~~
logiciels/orca.1413546682.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/17 13:51 de montap01