Calcul en Limousin

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====== ORCA ======
{{description>Orca}}

/* Description */

  * Site web : http://www.cec.mpg.de/forum/portal.php
  * Versions installées :
    * 3.0.2

La licence d'Orca permet son utilisation dans un cadre de recherche seulement.

===== Citation =====
Extrait de la licence d'utilisation :
<file>
4.If results obtained with ORCA package are published in scientific literature, 
you will reference the program as F. Neese: The ORCA program system (WIREs Comput Mol Sci 2012, 2: 73-78). 
Using specific methods included in ORCA may require citing additional articles, as described in the manual.
You agree to honor the request to cite additional papers as appropriate.
</file>
===== Utilisation =====
==== Sélection de la version ====
Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]]

<note warning>
Les versions MPI d'Orca sont liées à la librairie OpenMPI, qui n'est pas la librairie MPI usuelle sur notre cluster. Lorsque vous chargerez le module d'Orca, celui-ci va également charger le module MPI convenable, ce qui va donc changer aussi votre environnement pour MPI
</note>
Par exemple : 
  module load orca

==== Exemple d'utilisation en mode séquentiel ====
/* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */
/* Exemples de batch spécifiques */

Vous devez créer un fichier Orca, par exemple ''fichier_entree.inp''

Ensuite, créer un fichier batch pour //slurm// sur l'exemple suivant
<file>
#!/bin/bash

#SBATCH --partition=24h
#SBATCH --qos=24h
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --mem-per-cpu=100
#SBATCH --time=6:00:00

module load orca
orca fichier_entree.inp
</file>

==== Exemple d'utilisation en mode parallèle ====
Consultez la documentation d'Orca.

Votre fichier de commande Orca doit contenir l'une des syntaxes suivantes. Ici, on demande une parallélisation sur 4 processeurs :

<file>
! PAL4
   # everything from PAL2 to PAL8 is recognized
</file>
<file>
%pal nprocs 4
      end
</file>

Et le fichier de commande //slurm// :
<file>
#!/bin/bash
#SBATCH --partition=24h
#SBATCH --qos=24h
#SBATCH --ntasks=4
#SBATCH --mem-per-cpu=200
#SBATCH --time=04:00:00

module load orca

srun $ORCA_BIN/orca fichier_entree.inp
</file>

~~DISCUSSION~~

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