Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- logiciels:sparta [2016/08/18 09:35]
montap01 créée
+++ logiciels:sparta [2018/04/10 20:18] (Version actuelle)
montap01 [SPARTA]
@@ Ligne 6: / Ligne 6: @@
   * Site web : http://sparta.sandia.gov/index.html
   * Versions installées :
-    * 2016-07-11, avec librairie Intel MPI et support du format d'images PNG
+    * 2016-07-11 : avec librairie Intel MPI et support du format d'images PNG. L'exécutable s'appelle ''spa_icc+intel_mpi''
+    * 2017-03-16 : avec librairie MPI, support des images PNG et JPEG. Deux versions sont disponibles :
+      * ''spa_icc+intel_mpi'' -> compilé avec le compilateur Intel et librairie Intel MPI
+      * ''spa_gcc+intel_mpi'' -> compilé avec le compilateur GNU et librairie Intel MPI
+    * 2017-12-17 :
+      * ''spa_icc+intel_mpi'' -> compilé avec le compilateur Intel et librairie Intel MPI
+      * ''spa_kokkos_cuda'' -> compilé avec GNU GCC + OpenMPI 1.8.2 + Cuda 7.5
+      * ''spa_kokkos_cuda_ompi1107'' -> compilé avec GNU GCC + OpenMPI 1.10.7 + Cuda 7.5
+===== Citer SPARTA =====
+Si vous utilisez Sparta pour des travaux faisant l'objet de publications, vous êtes invité à porter attention au [[http://sparta.sandia.gov/doc/Section_intro.html | manuel de Sparta]], qui précise la chose suivante :
+<code>
+.5 Acknowledgments and citations
+SPARTA development has been funded by the US Department of Energy (DOE).
+If you use SPARTA results in your published work, please cite the paper(s) listed under
+the Citing SPARTA link of the SPARTA WWW page, and include a pointer to the SPARTA WWW
+Site (http://sparta.sandia.gov):
+The Publications link on the SPARTA WWW page lists papers that have cited SPARTA. If your
+paper is not listed there, feel free to send us the info. If the simulations in your paper
+produced cool pictures or animations, we'll be pleased to add them to the Pictures or Movies
+pages of the SPARTA WWW site.
+The core group of SPARTA developers is at Sandia National Labs:
+    Steve Plimpton, sjplimp at sandia.gov
+    Michael Gallis, magalli at sandia.gov
+</code>
 ===== Utilisation =====
@@ Ligne 16: / Ligne 45: @@
   module load sparta/2016-07-11
+==== Exemple de fichier batch ====
+Dans l'exemple suivant, nous lançons //sparta// sur 4 processeurs :
+<file>
+#!/bin/bash
+#
+#SBATCH --partition=normal
+#SBATCH --tasks=4
+#SBATCH --cpus-per-task=1
+#SBATCH --mem=2g
+module load sparta
+srun spa_icc+intel_mpi -sc none < in.free
+</file>
+Notes sur les différentes versions, avec support GPU / MPI
+  * Sparta 23Dec2017 avec Kokkos (GPU) + OpenMPI 1.8.2<code>
+#SBATCH --tasks=1
+#SBATCH --gres=gpu:2
+module unload configuration
+module load sparta/2017-12-23
+module load mpi/openmpi/1.8.2-gcc64
+# Uniquement en mono-tâche :
+mpirun spa_kokkos_cuda -sc none -sf kk -k on g 2 -pk kokkos reduction atomic comm threaded -v x 16 -v y 10 -v z 20 -v t 100 -in in.sphere -log "log.sparta.$SLURM_JOBID"
+# On comme ça avec plusieurs processus :
+srun --mpi=pmi2 spa_kokkos_cuda -sc none -sf kk -k on g 2 -pk kokkos reduction atomic comm threaded -v x 16 -v y 10 -v z 20 -v t 100 -in in.sphere -log "log.sparta.$SLURM_JOBID"
+</code>
+  * Sparta 23Dec2017 avec Kokkos (GPU) + OpenMPI 1.10.7 : arrive à fonctionner en parallèle<code>
+#SBATCH --tasks=2
+#SBATCH --gres=gpu:4
+module load sparta/2017-12-23
+module load mpi/openmpi/1.10.7-gcc64
+module load gcc/4.9.4
+srun --mpi=pmi2 spa_kokkos_cuda_ompi1107 -sc none -sf kk -k on g 2 -pk kokkos reduction atomic comm threaded -v x 16 -v y 10 -v z 20 -v t 100 -in in.sphere -log "log.sparta.$SLURM_JOBID"
+</code>

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