Cet article explique brièvement la configuration adoptée concernant l'affinité des processus sous slurm, c'est à dire leur liaison avec les CPU des nœuds de calcul.

L' affinité d'un processus permet de le lier à un ou plusieurs cœurs sur une machine multi-cœur (architecture SMP)

Le processus sera ainsi cantonné à un ensemble donné de cœurs pour son exécution. Il ne pourra pas être exécuté par Linux sur les autres cœurs du serveur.

• Sur notre cluster, les nœuds de calcul fonctionnent par défaut en mode partagé : plusieurs jobs peuvent s'exécuter en même temps sur le même nœud
• Dans un job slurm, vous demandez une réservation, par exemple pour 4 CPU
• Mais vous avez la liberté de lancer plus de 4 processus simultanés, ou un processus avec plus de 4 threads : Slurm ne contrôle pas cela
• Il y a donc un risque de surcharge du nœud qui va impacter les autres usagers

• Slurm dispose de plusieurs mécanismes permettant de circonscrire les ressources utilisables
• Nous utilisons le plus simple des deux via le paramètre TaskPlugin=task/affinity
• Slurm positionnera automatiquement l'affinité des processus pour limiter le nombre de CPU utilisables à la valeur demandée dans –cpus-per-task

Documentation slurm :

• http://www.schedmd.com/slurmdocs/cpu_management.html