Calcul en Limousin

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~~SLIDESHOW yatil~~
====== Slurm et programmation multithread ======

Cet article donne des indication sur l'utilisation de programmes //multi-threadés// (avec OpenMP par exemple) avec l'ordonnanceur Slurm.

===== Avant-propos =====
Un programme //multi-thread// est un programme qui est matérialisé par un seul processus. Ce processus aura plusieurs fils (pluriel de fil) d'exécution distincts. Ils sont aussi nommés //processus légers// ou //threads//.

Les threads s'exécutent **en parallèle** : ils peuvent ainsi utiliser plusieurs cœurs (ou CPU) en même temps sur une même machine. Notez qu'ils ne peuvent pas utiliser les ressources de plusieurs machines différentes.

===== Fichier Batch =====
Exemple de fichiers batch slurm adapté pour un programme OpenMP :

<file>
#!/bin/bash
#
#SBATCH --partition=normal
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=8
#SBATCH --mem-per-cpu=300
#SBATCH --time 00:01:00

export OMP_NUM_THREADS=$SLURM_CPUS_PER_TASK
./mon_programme
</file>

==== Options Slurm ====
  * L'option ''%%--%%ntasks=1'' est réduite à 1, on ne lance qu'un seul processus par la suite
  * L'option ''%%--%%cpus-per-task=8'' réserve 8 CPU (à proprement parler, des cœurs). Le programme pourra alors lancer jusqu'à 8 //threads// sans dépasser sa réservation. Notez que la valeur maximale dépend des processeurs équipant les nœuds du cluster.

==== Variable OpenMP ====
La variable d'environnement ''OMP_NUM_THREADS'' sert à indiquer à OpenMP le nombre de threads utilisables. **Il faut indiquer la même valeur que la réservation demandée**.

Pour ne pas se tromper, on utilise ici la variable ''$SLURM_CPUS_PER_TASK'' qui sera automatiquement positionnée par //slurm//.

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