Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- logiciels:bio:beagle [2014/10/22 14:19]
montap01 créée
+++ logiciels:bio:beagle [2014/10/22 14:46] (Version actuelle)
montap01 [Beagle]
@@ Ligne 7: / Ligne 7: @@
     * 4.0
+Les données //human genetic maps// et //human reference panel// ont été téléchargés sur CALI, voir le dossier  ''/opt/software/beagle''.
 ===== Citation =====
 <QUOTE>
@@ Ligne 24: / Ligne 25: @@
 Pour charger seulement l'environnement de //Beagle// dans une version particulière :
   module load bio/beagle/4.0
+Le module positionne la variable d'environnement ''$BEAGLE_LIB'', qui pointe sur le dossier contenant les fichiers //jar// de Beagle. Pour exécuter, vous devrez donc faire par exemple :
+  java -jar ${BEAGLE_LIB}/beagle.r1398.jar gt=... out=...
 ==== Travailler avec slurm ====

Calcul en Limousin