Différences

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montap01 [BWA]
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 ===== Citation =====
-How can I cite BWA?
+Les auteurs demandent la citation de leur article si vous utilisez des résultats de BWA dans vos propres publications :
-The short read alignment component (bwa-short) has been published:
+If you use the BWA-backtrack algorithm :
+  Li H. and Durbin R. (2009) Fast and accurate short read alignment with
+  Burrows-Wheeler transform. *Bioinformatics*, **25**, 1754-1760. [PMID:
+  [19451168][10]].
-  Li H. and Durbin R. (2009) Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler Transform. Bioinformatics, 25:1754-60. [PMID: 19451168]
+If you use the BWA-SW algorithm :
+  Li H. and Durbin R. (2010) Fast and accurate long-read alignment with
-If you use BWA-SW, please cite:
+  Burrows-Wheeler transform. *Bioinformatics*, **26**, 589-595. [PMID:
-  Li H. and Durbin R. (2010) Fast and accurate long-read alignment with Burrows-Wheeler Transform. Bioinformatics, Epub. [PMID: 20080505]
+  [20080505][11]].
-(See also Errata below for a minor correction to the formulae in these papers.)
+If you use the BWA-MEM algorithm or the **fastmap** command, or want to cite the whole BWA package :
+  Li H. (2013) Aligning sequence reads, clone sequences and assembly contigs
+  with BWA-MEM. [arXiv:1303.3997v2][12] [q-bio.GN].
 ===== Utilisation =====
 ==== Sélection de la version ====
-Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]]
+Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[:modules]]
 Par exemple :

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