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logiciels:gamess

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Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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logiciels:gamess [2014/10/09 19:01]
montap01 [GAMESS] 		logiciels:gamess [2014/10/10 19:20] (Version actuelle)
montap01
Ligne 7: Ligne 7:
   * Site web : http://www.msg.ameslab.gov/gamess/   * Site web : http://www.msg.ameslab.gov/gamess/
   * Versions installées :   * Versions installées :
-    * FIXME en cours d'installation+    * 2013/05/01 
  
 +===== Citation =====
 <note warning> <note warning>
 GAMESS n'est pas un logiciel libre. Sa licence impose entre autre la contrainte suivante :  GAMESS n'est pas un logiciel libre. Sa licence impose entre autre la contrainte suivante : 
Ligne 17: Ligne 18:
 </note> </note>
  
 +===== Paramètres de compilation =====
 +Plusieurs paramètres peuvent être réglés uniquement lors de la phase de compilation de GAMESS.
 +
 +==== Paramètres de parallélisation ====
 +  set MAXCPUS  = 16
 +  set MAXNODES = 256
 +
 +==== Paramètres de taille max des systèmes ====
 +Les paramètres de taille max modificables sont : 
 +
 +<code>
 +MXATM = max number of ab initio atoms
 +MXAO  = max number of basis functions
 +MXGSH = max number of Gaussians per shell
 +MXSH  = max number of symmetry unique shells
 +MXGTOT= max number of symmetry unique Gaussians
 +MXRT  = max number of MCSCF/CI states
 +MXFRG = max number of effective fragment potentials
 +MXDFG = max number of different effective fragments
 +MXPT  = max number of points in any one term of any EFP
 +MXFGPT= maximum storage for all EFPs, and is sized for a large number of EFPs 
 +        with a small number of points (solvent applications), or a smaller
 +        number of EFPs with many points (biochemistry).
 +MXSP  = max number of spheres (sfera) in PCM
 +MXTS  = max number of tesserae in PCM
 +MXABC = max number of A,B,C matrices in the COSMO algorithm. The default value 
 +        of 6000 allows the construction of cavities for roughly 150 to 200 atoms.
 +</code>
 +
 +La version ''00'' de //Gamess// a été compilée avec les paramètres suivants (valeurs par défaut) : 
 +
 +<code>
 +MXATM=2000
 +MXAO=8192
 +MXGSH=30
 +MXSH=5000
 +MXGTOT=20000
 +MXRT=100
 +MXFRG=1050
 +MXDFG=5
 +MXPT=2000
 +MXFGPT=12000
 +MXSP=0
 +MXABC=6000
 +</code>
 +
 +Si vous avez besoin de systèmes plus grands, donnez-nous les valeurs adaptées.
 ===== Utilisation ===== ===== Utilisation =====
 +
 ==== Sélection de la version ==== ==== Sélection de la version ====
 Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]] Pour sélectionner la version voulue : utiliser les [[..:modules]]
Ligne 23: Ligne 72:
 Par exemple :  Par exemple : 
   module load gamess   module load gamess
 +
 +==== Commande GAMESS ====
 +Une fois l'environnement chargé, le binaire s'appelle ''gamess.<build>.x''
  
 ==== Travailler avec slurm ==== ==== Travailler avec slurm ====
 /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */ /* Faut-il utiliser des fichiers de commandes spéciaux ? */
 /* Exemples de batch spécifiques */ /* Exemples de batch spécifiques */
logiciels/gamess.1412874061.txt.gz · Dernière modification: 2014/10/09 19:01 de montap01

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